DNA的二级结构是指两条多核苷酸链反向平行盘绕所形成的双螺旋结构。这种结构中，两条链以相同的旋转绕同一个公共轴形成右手双螺旋，螺旋的直径约为2.0nm。两条链是反向平行的，一条是5’到3’方向，另一条是3’到5’方向。糖-磷酸骨架位于双螺旋的外侧，而碱基平面位于链的内侧。相邻碱基对之间的轴向距离为0.34nm，每个螺旋的轴距（即相邻碱基对中心之间的距离）为3.4nm。DNA的二级结构主要有两种形式：A-DNA和B-DNA，其中B-DNA是最常见的DNA形式。
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